1916年	1月13日，绥远特别区都统潘矩楹以勾结乱党、图谋不规之罪名，杀害了中国国民党党员王定圻。     1月23日，民国政府交通部决定改京张、张绥铁路为京绥铁路。     日本商人在赤峰开办药房、洋行和公司，收购甘草、皮毛等土特产品。     奉系军阀张作霖以武力强垦科尔沁左翼中旗辽河南北之牧场4 000余方，计18万垧，270万亩。
			1917年	2月，日本在赤峰设驻热河领事馆。     绥远特别区都统蒋雁行招抚巨匪卢占魁，并委其为绥远游击骑兵旅少将旅长，率匪众万余人驻防后套，广种大烟，为害地方。11月，卢占魁再次生变，匪徒分股窜扰察哈尔特别区之陶林、凉城、丰镇、兴和、商都诸县，民国政府从北京派军队进剿；12月，察哈尔官军在凉城县岱海滩一带重创匪徒，卢占魁重伤，不久败逃陕西。     7月，西辽河通辽段以上连降暴雨，各河流洪水泛滥，通辽全境被淹，平地水深2米，民房被毁十之六七，淹死人口十之有二。     8月，内蒙古西部乌拉特前旗、后套、包头、归绥、清水河、卓资等27个旗县流行肺鼠疫病，归绥、包头等均设检查所和隔离所，进行防治，直至翌年3月才得控制，死亡1.38万人。     是年，在归绥旧城开设“共和医院”，内设内科、外科、检验、药房及病床。此为何秉如私人创办。另外开办了归绥私立医学传习所，培养医护人员。这是归绥地区开设近代医院之始。
			1918年	4月22日，由张家口至外蒙古库伦之公路通车。    9月28日，民国政府与日本订立《满蒙四路二千万元垫款合同》；是年，日本“南满洲铁道株式会社”在奉天创办“满蒙毛织株式会社”，资本1 000万元；日本人在巴林右旗大板开办蒙古产业公司，经营牲畜、皮毛、土特产品，经销布匹、杂货、烟酒、米面等。
			1919年	1月3日，京绥铁路向日本借款300万元，以1918年所发公债余额入抵，用以展修丰镇以西之铁路；1921年修至归绥，5月1日通车；1922年又展修至包头。     5月4日，在北京蒙藏学校读书的土默特旗蒙古族青年荣耀先，以该校代表身份参加了北京14所大专院校召开的反对巴黎和会示威游行准备会议；当日，该校蒙古族以及其他民族的学生，冲破校方的阻拦，参加了天安门前的集会，反对巴黎和会，取消“二十一条”，会后举行游行示威，火烧赵家楼，并举行总罢课。5月，荣耀先代表蒙藏学校参加了北京中等以上学校学生联合会成立大会。在北京的蒙古族青年学生随即回到内蒙古宣传鼓动，北京“五四”运动的怒潮波及到了内蒙古。5月中旬，归绥中学、土默特高等小学校等学校组织学生会，纷纷举行罢课和示威游行，绥远总商会通电支持学生的爱国行动。在内蒙古东部赤峰、喀喇沁右旗、通辽等地的学校也举行声援北京“五四”运动的活动；6月5日，赤峰“外交后援会”、“学生救国会”组织游行示威，痛打日本领事馆翻译米次，围困外交部驻赤峰交涉署，捣毁了“巨庆和”洋货商店。 满洲里铁路装卸工举行罢工30多天，要求增加工资，争取8小时工作制，迫使路局答应了工人的要求。     9月8日，北京政府与日本政府签订《中日四洮铁路借款合同》。     11月7日，外蒙古王公上层上书民国政府，呈请撤销外蒙古“自治”，22日，民国政府正式撤销外蒙古“自治”。
			1920年	1月6日，呼伦贝尔蒙古封建上层电呈民国政府撤销呼伦贝尔“特别区域”；1月28日，民国政府宣布撤销呼伦贝尔“特别区域”；民国政府批准在呼伦贝尔增设呼伦县，胪膑县、室韦县和奇乾设治局；改呼伦贝尔兵备道为善后督办。     7月，奉系军阀占领热河特别区和察哈尔特别区，各系军阀开始争夺内蒙古地区；18日，绥远特别区都统蔡成勋通电派兵参加直皖军阀战争。    12月1日，毛泽东致信蔡和森，讨论在中国建立无产阶级政党问题时提出：“帮助蒙古、新疆、西藏、青海自治自决，都是很要紧的。”